Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox12Q04890 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Atcayos-201ENSMUST00000129834 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox12Q04890 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms