Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cxcr5Q04683 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms