Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl7Q03366 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl7Q03366 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms