Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Thbs2Q03350 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Thbs2Q03350 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Thbs2Q03350 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Thbs2Q03350 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Thbs2Q03350 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Thbs2Q03350 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Thbs2Q03350 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms