Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NfiaQ02780 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms