Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gjb5Q02739 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms