Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms