Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cacna1cQ01815 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms