Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms