Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PrcdQ00LT2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms