Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb2Q00977 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms