Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms