Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Arf1P84078 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Arf1P84078 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms