Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxd13P70217 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd13P70217 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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