Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms