Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
UbdP63072 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
UbdP63072 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
UbdP63072 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
UbdP63072 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms