Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps3P62908 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms