Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ufm1P61961 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms