Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp25P57080 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms