Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp5bP56480 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms