Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Irf5P56477 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Irf5P56477 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Irf5P56477 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Irf5P56477 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irf5P56477 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irf5P56477 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irf5P56477 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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