Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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