Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms