Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms