Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbP41155 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbP41155 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtbP41155 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms