Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms