Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms