Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Grik2P39087 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms