Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtlP38585 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TtlP38585 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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