Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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