Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BgnP28653 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BgnP28653 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BgnP28653 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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