Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ggta1P23336 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms