Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrkchP23298 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms