Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PparaP23204 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PparaP23204 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218 ms