Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TP20293 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TP20293 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TP20293 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms