Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms