Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Prmt7-201ENSMUST00000071592 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms