Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms