Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P10404 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P10404 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P10404 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P10404 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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