Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P04213 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P04213 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P04213 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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