Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01641 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01641 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01641 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P01641 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01641 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01641 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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