Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ccl20O89093 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ccl20O89093 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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