Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20878L7N244 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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