Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm2056J3QQ02 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm2056J3QQ02 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm2056J3QQ02 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm2056J3QQ02 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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