Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn34aG3UW52 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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