Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6619F6URP1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms