Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms