Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syngap1F6SEU4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syngap1F6SEU4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syngap1F6SEU4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syngap1F6SEU4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syngap1F6SEU4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syngap1F6SEU4 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syngap1F6SEU4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syngap1F6SEU4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syngap1F6SEU4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syngap1F6SEU4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms