Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
FgaE9PV24 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FgaE9PV24 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms