Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf217D3YYI7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf217D3YYI7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms